種質資源中期庫保存種質資料為應用收集品材料，即用于提供種質分發、研究及評價鑒定。主要負責某一類作物種質資源收集、鑒定評價、編目、中期保存、分發、交換和繁殖更新，以及種質信息匯編，建立種質信息數據庫和信息共享平臺：入庫貯藏種子需進行前處理操作，包括生活力檢測、含水量測定、干燥包裝等：貯藏過程需定期監測種子生活力。

種質資源長期庫是保存種質資源為基礎收集品，即每份種質樣品都不一樣，需經過初步農藝性狀鑒定和編目登記，并保持原始種質樣品的遺傳完整性，貯存種質材料用于種質資源的長期保存，一般不對外提供分發，僅向中期庫提供繁殖用種子。入庫貯藏種子需進行前處理操作，包括生活力檢測、含水量測定、干燥包裝等；貯藏過程需定期監測種子生活力：種質信息匯編規范并建立數據庫；具有種質保存技術研究條件。

中藥材種質資源庫利用儀器設備控制貯藏環境，是長期貯存作物種質的倉庫，又稱基因庫。發掘和收集各種農作物品種種子，科學地加以貯藏，使種質在幾十年、甚至數百年之后仍具有原有的遺傳特性和很強的發芽力，對品種改良，培育高產、優質、抗逆性強的新品種，為生物學理論研究提供豐富的種質和研究材料具有重要意義。

種質資源短期庫主要用于保存待鑒定評價的新收集種質資源的短期或臨時保存；也可作為作物改良或研究而收集的種質材料，這類種質材料也成為工作收集品。

種質資源保存庫是針對各類種質資源進行收集和保存的大型設施，根據其保存年限主要可分為超長期保存庫、長期保存庫、中期保存庫、短期保存庫和普通種子庫等。